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酶解or超声?看小美非接触超声波DNA打断仪如何大显身手

时间:2022-11-03   作者:小美超声   来源:上海净信   点击:56次

  在NGS检测实验中,DNA文库构建的第一步就是将DNA随机打断成符合各测序平台读长的片段。相信熟悉NGS文库构建的科研人员一定纠结过这个问题,是用酶解打断还是超声波打断?

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  目前DNA打断的最主要的方法超声法和酶解法。但是这两种方法在实际使用中各具优势,需要根据实验者自身的情况进行选择。

  

  超声波打断法:

  

  操作简单,耗时短,成本低;随机片段化,无GC序列偏好;剪切效果不受DNA浓度影响

  

  片段化结果集中度高,目的长度片段得率高。

  

  酶切法:

  

  实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高;存在序列偏好性;需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响;目标长度片段集中度较低。

  

  超声打断法的优势显而易见,而常用的超声波打断仪分为接触式和非接触式。相比传统的探头超声波破碎仪,探头与样品直接接触,一次只能处理一个样品,实验周期长。小美非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品可在密闭容器下进行破碎,不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,此款仪器具有处理高通量,样本低损耗,无交叉污染等优势。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台不可缺少的标准化工具。

  

  小美超声非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品具有通量高、实验一致性好,实验重复性好、片段得率高等优点。专为二代测序DNA样本与染色质免疫共沉淀实验样本前处理量身订做的,应用领域包含:细菌细胞破碎、蛋白质抽提;二代测序样本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均质、加速溶解、催化反应等。

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  采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;用于无菌、可超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。深受各大基因公司、生物公司、测序公司的青睐!

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